Le récepteur de la mélanocortine de type 1 (MC1R) ou le locus E (le gène « extension ») réglemente la production du pigment dans les mélanocytes. La mutation dans le gène MC1R conduit à un récepteur non fonctionnel et cause que les mélanocytes du pelage ne produisent que la phaeomélanine jaune à rouge ainsi qu'elle empêche l'expression d'autre locus responsables pour la couleur du pelage. Le gène avec cette mutation récessive est l'allèle e. Étant donné qu'il est récessif, le chien doit avoir deux copies de cet allèle pour que le pelage soit jaune à rouge. La couleur de la phaeomélanine chez les différentes races des chiens avec le génotype e/e peut varier. Par exemple, le pelage des Golden Retriever est jaune, tandis que les Setter irlandais ont le pelage rouge. Le locus E chez les chiens avec le génotype e/e n'a pas d'influence sur la synthèse du pigment du museau, des coussinets et des yeux. Leur couleur dépend des allèles du locus B.

Un allèle E normal qui est dominant permet au chien de produire l'eumélanine noir ou la formation du pigment est influencée par d'autre locus. À cause de la dominance de l'allèle E, une seule copie est suffisante pour qu'il soit exprimé; les chiens avec le génotype E/E et E/e expriment normalement les autres locus responsables pour la couleur. Une grande variabilité des couleurs du pelage entre les races est due aussi à trois gènes importants. Différentes combinaisons d'allèles du locus B, locus A et locus K sont responsables pour l'expression de la couleur du pelage.